Cr茅ditos ECTS
Cr茅ditos ECTS: 3
Horas ECTS Criterios/Memorias
Trabajo del Alumno/a ECTS: 51
Horas de Tutor铆as: 3
Clase Expositiva: 9
Clase Interactiva: 12
Total: 75
Lenguas de uso
Castellano, Gallego
Tipo:
Materia Ordinaria 惭谩蝉迟别谤 RD 1393/2007 - 822/2021
Departamentos:
Matem谩tica Aplicada,
惭补迟别尘谩迟颈肠补蝉
脕谤别补蝉:
Matem谩tica Aplicada, Geometr铆a y Topolog铆a
Centro
Facultad de Medicina y Odontolog铆a
Convocatoria:
Primer semestre
Docencia:
Con docencia
惭补迟谤铆肠耻濒补:
Matriculable
Introducir al alumno en el manejo de herramientas bioinform谩ticas, en particular algunas de las que se usar谩n en las diferentes asignaturas del master.
1. Bases de datos
Acceso y manejo de la informaci贸n contenida en los principales bases de datos 鈥溍砿icos鈥� (gen贸micos, transcript贸micos, prote贸micos, epigen贸micos), de expresi贸n g茅nica, etc.
2. An谩lisis y manejo de secuencias
Algoritmos y programas de alineamiento de secuencias de nucle贸tidos y de proteinas. alineamiento de genomas, alineamiento de lecturas frente a un genoma, etc. Ideas de ensamblado de genomas. Diferentes m茅todos para la reconstrucci贸n de 谩rboles y redes filogen茅ticas mediante el uso de secuencias de ADN.
3. 叠颈辞颈苍蹿辞谤尘谩迟颈肠补 funcional.
4. An谩lisis de pathways y redes g茅nicas. El uso de los t茅rminos GO para el an谩lisis funcional. Utilizaci贸n de herramientas bioinform谩ticas dise帽adas para ello.
Deonier, R. C., Tavar茅, S. & Waterman, M. S., Computational Genome Analysis, An introducction, Springer, 2005, USA
Salemi, M. & Vandamme A. (Ed.) The Phylogenetic Handbook, Cambridge University Press, 2003, UK.
Stekel, Dov, Microarray Bioinformatics, Cambridge University Press, 2003, UK.
1. Utilizar BLAST para b煤squeda de secuencias en bases de datos, alinearlas con CLUSTAL y (en su caso) hacer un an谩lisis filogen茅tico de las mismas.
2. Utilizar las bases de datos GO y KEGG para hacer anotaci贸n funcional.
La docencia expositiva e interactiva ser谩 presencial y se complementar谩 con el curso virtual de la materia.
Las tutor铆as ser谩n presenciales.
Examen pr谩ctico por medos telem谩ticos.
Advertencia. Para los casos de realizaci贸n fraudulenta de los test o pruebas (plagios ou uso indebido de las tecnolog铆as) ser谩 de aplicaci贸n lo recogido en la Normativa de avaliaci贸n do rendemento acad茅mico dos estudantes e de revisi贸n de cualificaci贸ns.
Sobre tres horas semanales
Jose Antonio Alvarez Dios
Coordinador/a- Departamento
- Matem谩tica Aplicada
- 脕谤别补
- Matem谩tica Aplicada
- 罢别濒茅蹿辞苍辞
- 881813353
- Correo electr贸nico
- joseantonio.alvarez.dios [at] usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Profesor/a: Titular de Universidad
Antonio M. G贸mez Tato
- Departamento
- 惭补迟别尘谩迟颈肠补蝉
- 脕谤别补
- Geometr铆a y Topolog铆a
- 罢别濒茅蹿辞苍辞
- 881813151
- Correo electr贸nico
- antonio.gomez.tato [at] usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Profesor/a: Catedr谩tico/a de Universidad
| Martes | |||
|---|---|---|---|
| 09:30-10:30 | Grupo /CLE_01 | Gallego, Castellano | Aulario-Aula 10 |
| Jueves | |||
| 09:30-11:30 | Grupo /CLE_01 | Castellano, Gallego | Aulario-Aula 10 |