Cr茅ditos ECTS
Cr茅ditos ECTS: 4.5
Horas ECTS Criterios/Memorias
Horas de Titor铆as: 1.5
Clase Expositiva: 20
Clase Interactiva: 17
Total: 38.5
Linguas de uso
颁补蝉迟别濒谩苍, Galego
Tipo:
Materia Ordinaria Grao RD 1393/2007 - 822/2021
Departamentos:
Bioqu铆mica e Biolox铆a Molecular,
Qu铆mica Org谩nica
脕谤别补蝉:
Bioqu铆mica e Biolox铆a Molecular, Qu铆mica Org谩nica
Centro
Facultade de Biolox铆a
Convocatoria:
Segundo semestre
Docencia:
Con docencia
惭补迟谤铆肠耻濒补:
Matriculable
鈥� Enumerar o estratexias e m茅todos m谩is al贸 com煤n en enxe帽ar铆a de prote铆nas.
鈥� Identificar o Aplicaci贸ns pr谩cticas de o enxe帽ar铆a de prote铆nas en biotecnolox铆a.
鈥� Distingue o m茅todos de representar o estruturas de biomol茅culas e saber usar el software para seu an谩lise.
鈥� Identificar o factores iso influencia en el dobrar de prote铆nas.
Clases Expositivas
鈥� Introduci贸n 谩 enxe帽er铆a de prote铆nas.
鈥� Fundamentos de estrutura de prote铆nas. Estrutura e propiedades dos amino谩cidos, an谩lises conformacional. Pregamento de prote铆nas: Termodin谩mica e cin茅tica de plegamiento.
鈥� M茅todos de determinaci贸n de prote铆nas. Bases de datos estruturais e software para representaci贸n de estruturas de biomol茅culas.
鈥� Interacci贸ns principais que estabilizan elementos de estrutura secundaria e estrutura terciaria. Dese帽o de h茅lices 伪. Dese帽o racional de prote铆nas.
鈥� Evoluci贸n dirixida de Prote铆nas: mutax茅neses e recombinaci贸n. M茅todos de screening de prote铆nas evolucionadas.
鈥� Casos representativos de prote铆nas modificadas.
Seminarios
鈥� Exposici贸n de traballos por parte do alumnado de casos reais de enxe帽er铆a e evoluci贸n de prote铆nas.
Aula de inform谩tica
鈥� Representaci贸n e estudo de estruturas de biomol茅culas. Uso do programa UCSF Chimera ().
鈥� Uso de bases de datos estruturais (PDB, ) .
鈥� Uso de servidores de modelizaci贸n (ROSIE, , ROSIE 茅 unha interface web para o paquete de software Rosetta 3.x de modelado molecular que proporciona ferramentas probadas experimentalmente e en r谩pida evoluci贸n para a predici贸n de estruturas tridimensionales e o dese帽o de alta resoluci贸n de prote铆nas), e AlphaFold 3 (, AlphaFold 茅 un servizo web que pode xerar predici贸ns altamente precisas de estruturas biomoleculares de prote铆nas).
鈥� Uso do servidor Swissmodel para analizar variantes de prote铆nas.
鈥� Afianzamento de conceptos estruturais mediante resoluci贸n de problemas no programa FoldIt (). FoldIt, 茅 un popular xogo cient铆fico en li帽a, no que os xogadores utilizan os principios do pregamento de prote铆nas para permitirlles resolver as estruturas 3D das prote铆nas. A versi贸n educativa consta de 29 crebacabezas divididos en 9 niveis que gu铆an ao estudante a trav茅s dun conxunto est谩ndar de temas no ensino da bioqu铆mica, que incl煤en interacci贸ns at贸micas, o efecto hidrof贸bico, amino谩cidos, estrutura primaria, estrutura secundaria, estrutura terciaria, v铆as de pregamento, e reco帽ecemento de prote铆nas.
Probas peri贸dicas
鈥� Como parte do proceso de avaliaci贸n continua e para facer un seguimento da asistencia e adquisici贸n de co帽ecementos por parte do alumnado, realizaranse periodicamente pequenos controles tipo test (uns 10 minutos de duraci贸n) ao comezo dalgunhas clases expositivas.
Tutor铆as de grupo
鈥� Reforzo dos contidos da materia a trav茅s de presentaci贸ns ou discusi贸n de temas relacionados coa materia no contexto da biotecnolox铆a.
Exame
鈥� Como parte da avaliaci贸n (70% da nota final no caso de terse en conta a evaluaci贸n continua) realizarase un exame nas datas indicadas na programaci贸n anual. O exame constar谩 de dous partes, correspondentes aos fundamentos estructur谩is e t茅cnicas bioqu铆micas de enxe帽er铆a de prote铆nas.
鈥� V. K枚hler (Ed.) Protein Design, Methods and Applications in Methods in Molecular Biology, 2014 Humana Press.
鈥� K. J. Jensen (Ed.). Peptide and Protein Design for Biopharmaceutical Applications, 2009 John Wiley & Sons.
鈥� E Buxbaum, Fundamentals of Protein Structure and Function, 2007 Springer.
鈥� C. K枚hrer, U. L. RajBhandary (Eds.). Protein Engineering in Nucleic Acids and Molecular Biology series no. 22, 2009, Springer.
鈥� P. Kaumaya, Protein Engineering, 2012, InTech.
Competencias
鈥� Comp01: Que os estudantes te帽an a capacidade de reunir e interpretar datos relevantes (normalmente dentro da s煤a 谩rea de estudo) para emitir xu铆zos que incl煤an unha reflexi贸n sobre temas relevantes de 铆ndole social, cient铆fica ou 茅tica.
鈥� Comp02: Que os estudantes sexan capaces, tanto por escrito como de forma oral, de debater e de transmitir informaci贸n, ideas, problemas e soluci贸ns relativos 谩 Biotecnolox铆a a un p煤blico tanto especializado como non especializado/xeral.
鈥� Comp03: Que os estudantes desenvolvesen aquelas habilidades de aprendizaxe necesarias para emprender estudos posteriores cun alto grao de autonom铆a.
鈥� Comp04: Que os estudantes saiban aplicar os co帽ecementos te贸ricos-pr谩cticos adquiridos no grao dunha forma profesional e sexan competentes no formulaci贸n/resoluci贸n de problemas, as铆 como na elaboraci贸n/defensa de argumentos tanto en contextos acad茅micos como profesionais relacionados coa innovaci贸n e a industria biotecnol贸xica.
鈥� Comp05: Estudar e aprender de forma aut贸noma, con organizaci贸n de tempo e recursos, novos co帽ecementos e t茅cnicas en Biotecnolox铆a e adquirir capacidade para traballar en equipo.
Habilidades e Destrezas
鈥� H/D01: Pensar de forma integrada e abordar os problemas desde diferentes perspectivas con razoamento cr铆tico.
鈥� H/D02: Buscar, procesar, analizar/interpretar e sintetizar informaci贸n e resultados relevantes procedente de diversas fontes e obter conclusi贸ns en temas relacionados coa Biotecnolox铆a.
鈥� H/D03: Organizar e planificar o seu traballo.
鈥� H/D04: Interpretar resultados experimentais e identificar elementos consistentes e inconsistentes.
鈥� H/D06: Manter un compromiso 茅tico, as铆 como un compromiso coa igualdade e a integraci贸n.
鈥� H/D11: Comprender e saber aplicar os principios f铆sico-qu铆micos dos procesos biol贸xicos con aplicaci贸n en Biotecnolox铆a, as铆 como as principais ferramentas utilizadas para investigalos.
鈥� H/D12: Saber aplicar as t茅cnicas instrumentais e os protocolos de traballo nun laboratorio, aplicando as normativas e t茅cnicas relacionadas con seguridade e hixiene, xesti贸n de residuos e calidade.
颁辞帽别肠别尘别苍迟辞蝉/颁辞苍迟颈诲辞蝉
鈥� Con01: Co帽ecer os conceptos, m茅todos e resultados m谩is importantes das distintasvramas da Biotecnolox铆a.
鈥� Con04: Co帽ecer as t茅cnicas que permiten determinar as propiedades das prote铆nas e ser capaz de analizar e manipular a s煤a estrutura de acordo con a s煤a aplicaci贸n en Biotecnolox铆a.
鈥� A docencia expositiva e interactiva (inclu铆das as pr谩cticas) ser谩 presencial. Excepcionalmente, a docencia presencial poderase combinar coa docencia virtual ata un m谩ximo do 10% das horas totais da materia.
鈥� Clases expositivas. O profesor desenvolver谩 o contido do programa facendo uso de exercicios e exemplos pr谩cticos que ilustren os conceptos explicados. Combinaranse as explicaci贸ns con materiais da bibliograf铆a, as铆 como de referencias de revistas cient铆ficas.
鈥� Seminarios e Titor铆as en grupo. Os alumnos expo帽er谩n individualmente traballos sobre casos reais de dese帽o e evoluci贸n de p茅ptidos e prote铆nas nos seminarios. Incentivarase que os alumnos participen activamente nos seminarios ao longo do todo o curso, sendo esta participaci贸n uno dos criterios de avaliaci贸n. Poderanse expor problemas para que o estudante tente resolvelos de forma aut贸noma, entregando a s煤a soluci贸n ao profesorado con antelaci贸n 谩s clases de seminario en que se resolver谩n. Nas devanditas clases, os alumnos expo帽er谩n as s煤as soluci贸ns, encarg谩ndose o profesor de resolver as d煤bidas e dificultades que se expo帽an. Ocasionalmente, nos seminarios tam茅n se propo帽er谩n exercicios breves para resolver no momento, que se ter谩n en conta na avaliaci贸n.
鈥� Titor铆as individuais. As titor铆as ser谩n fundamentalmente de car谩cter presencial, se been poder谩n realizarse parcialmente de maneira virtual. Farase un seguimento m谩is pr贸ximo ao traballo do alumno, reforzando a docencia oficial con titor铆as persoais segundo as necesidades de cada estudante.
鈥� Clases pr谩cticas na aula de inform谩tica. D煤as sesi贸ns nas que os estudantes poder谩n familiarizarse con diversas ferramentas utilizadas para a representaci贸n estrutural de biomol茅culas, as bases de datos m谩is relevantes, as铆 como alg煤n software para o dese帽o de prote铆nas. As pr谩cticas de inform谩tica poder谩n ser en modalidade virtual, en todo caso cun m谩ximo do 25% das horas pr谩cticas da materia.
鈥� Aula virtual (Moodle). A materia contar谩 cunha aula virtual na que se incluir谩 todo o material de apoio docente do curso, os calendarios, ligaz贸ns a p谩xinas de interese, etc. Esta plataforma tam茅n cont茅n foros de discusi贸n e correo interno o que proporciona unha excelente comunicaci贸n entre profesores e estudantes.
鈥� A avaliaci贸n ser谩 igual para todos os alumnos nas d煤as oportunidades.
鈥� A asistencia a clases te贸ricas, seminarios e clases pr谩cticas (laboratorio e aula de inform谩tica) 茅 obrigatoria, salvo causas xustificables. Para poder aprobar a materia, a asistencia ao exame tam茅n 茅 obrigatoria. A presentaci贸n de todas as actividades individuais e colectivas (cuestionario de pr谩cticas individual + traballo en grupo) 茅 obrigatoria para todo o alumnado e requisito para aprobar a materia, excepto para os estudantes con dispensa oficial.
鈥� A avaliaci贸n continua realizarase combinando actividades presenciais, tales como traballo en equipo, exposici贸ns ou resoluci贸n de cuesti贸ns en clase, con actividades en li帽a empregando os recursos das plataformas institucionais (Aula Virtual-Moodle e Microsoft Teams). Como parte do proceso de avaliaci贸n continua e para facer un seguimento da asistencia e adquisici贸n de co帽ecementos por parte do alumnado, realizaranse periodicamente pequenos controles tipo test (uns 10 minutos de duraci贸n) ao comezo dalgunhas clases expositivas. Resultados de aprendizaxe avaliados: Comp01, Comp02, H/D01, H/D02, H/D03, H/D04, H/D06, H/D11, H/D12.
鈥� A nota de avaliaci贸n continua s贸 se sumar谩 谩 nota do exame se a nota 茅 superior a 4.5.
鈥� Exame Final (70% da nota no caso de terse en conta a avaliaci贸n continua): O exame constar谩 de d煤as partes, correspondentes aos fundamentos estruturais e t茅cnicas bioqu铆micas de enxe帽er铆a de prote铆nas, e cubrir谩 todos os aspectos relacionados cos contidos da materia. Resultados de aprendizaxe avaliados no exame: Comp03, Comp04, Comp05, H/D01, H/D02, H/D03, H/D04, H/D06, H/D011, H/D012, Con01, Con04.
鈥� A cualificaci贸n final do estudante na materia ser谩 a mellor entre 1) a cualificaci贸n obtida no exame final ou 2) o resultado de facer unha media ponderada entre a cualificaci贸n no exame final (70%) e a nota derivada da avaliaci贸n continua do traballo nos seminarios, pr谩cticas e titor铆as (30%). Estes mesmos instrumentos ser谩n utilizados para avaliar as competencias da materia, con particular 茅nfase nas competencias espec铆ficas da materia.
鈥� Para os casos de realizaci贸n fraudulenta de exercicios ou probas ser谩 de aplicaci贸n o recollido na 鈥淣ormativa de avaliaci贸n do rendemento acad茅mico dous estudantes e de revisi贸n de cualificaci贸ns鈥� que se pode consultar na seguinte ligaz贸n: .
Traballo do estudante, 72h
脡 importante destacar que o traballo persoal do alumno ten que ser continuado ao longo da materia, pois se trata dunha materia na que os contidos que se imparten a medida que avanza o programa fundam茅ntanse nos co帽ecementos adquiridos nos temas previos.
Jose Manuel Martinez Costas
- Departamento
- Bioqu铆mica e Biolox铆a Molecular
- 脕谤别补
- Bioqu铆mica e Biolox铆a Molecular
- 罢别濒茅蹿辞苍辞
- 881815734
- Correo electr贸nico
- jose.martinez.costas [at] usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Profesor/a: Catedr谩tico/a de Universidade
Marco Eugenio Vazquez Sentis
Coordinador/a- Departamento
- Qu铆mica Org谩nica
- 脕谤别补
- Qu铆mica Org谩nica
- 罢别濒茅蹿辞苍辞
- 881815738
- Correo electr贸nico
- eugenio.vazquez [at] usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Profesor/a: Catedr谩tico/a de Universidade
Alejandro Seco Gonzalez
- Departamento
- Qu铆mica Org谩nica
- 脕谤别补
- Qu铆mica Org谩nica
- Correo electr贸nico
- alejandro.seco.gonzalez [at] usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Predoutoral 奇趣腾讯分分彩
Daniel Abella L贸pez
- Departamento
- Bioqu铆mica e Biolox铆a Molecular
- 脕谤别补
- Bioqu铆mica e Biolox铆a Molecular
- Correo electr贸nico
- daniel.abella [at] rai.usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Predoutoral Ministerio
Adri谩n L贸pez Teijeiro
- Departamento
- Bioqu铆mica e Biolox铆a Molecular
- 脕谤别补
- Bioqu铆mica e Biolox铆a Molecular
- Correo electr贸nico
- adrianlopez.teijeiro [at] usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Predoutoral Ministerio
| Martes | |||
|---|---|---|---|
| 09:00-10:00 | Grupo /CLE_01 | 颁补蝉迟别濒谩苍 | Aula 08. Louis Pasteur |
| 26.05.2025 10:00-14:00 | Grupo /CLE_01 | Aula 04: James Watson e Francis Crick |
| 10.07.2025 10:00-14:00 | Grupo /CLE_01 | Aula 03. Carl Linneo |