Cr茅ditos ECTS
Cr茅ditos ECTS: 6
Horas ECTS Criterios/Memorias
Horas de Titor铆as: 3
Clase Expositiva: 27
Clase Interactiva: 21
Total: 51
Linguas de uso
颁补蝉迟别濒谩苍, Galego
Tipo:
Materia Ordinaria Grao RD 1393/2007 - 822/2021
Departamentos:
Qu铆mica Org谩nica,
惭补迟别尘谩迟颈肠补蝉
脕谤别补蝉:
Qu铆mica Org谩nica, Xeometr铆a e Topolox铆a
Centro
Facultade de Biolox铆a
Convocatoria:
Primeiro semestre
Docencia:
Con docencia
惭补迟谤铆肠耻濒补:
Matriculable
- Acceder e manexar a informaci贸n contida nas principais bases de datos en bioinform谩tica.
- Saber analizar e manexar secuencias de nucle贸tidos e amino谩cidos.
- Saber realizar ali帽amentos, ensamblaxes e relaci贸ns de filogenia entre secuencias.
- Co帽ecer e saber utilizar os m茅todos de an谩lises de expresi贸n g茅nica.
- Utilizar as ferramentas bioinform谩ticas para a an谩lise estrutural e funcional de mol茅culas
Bases de datos (5 CLE)
Acceso e manexo da informaci贸n contida nas principais bases de datos 鈥� 贸micos鈥� (xen贸micos, transcript贸micos, prote贸micos, epigen贸micos), de expresi贸n g茅nica, etc.
An谩lise e manexo de secuencias (5 CLE)
Algoritmos e programas de ali帽amento de secuencias de nucle贸tidos e de proteinas. ali帽amento de xenomas, ali帽amento de lecturas fronte a un xenoma, etc. Ideas de ensamblado de xenomas. Diferentes m茅todos para a reconstruci贸n de 谩rbores e redes filogen茅ticas mediante o uso de secuencias de ADN.
An谩lise de datos de expresi贸n g茅nica. (5 CLE)
Os diferentas tipos de datos existentes ( Microarrays, RNA- Seq, etc). Alg煤ns dos m茅todos e programas estat铆sticos m谩is utilizados para a s煤a an谩lise. Xeraci贸n de listas de xenes con expresi贸n diferencial.
叠颈辞颈苍蹿辞谤尘谩迟颈肠补 funcional. (5 CLE)
An谩lise de pathways e redes g茅nicas. O uso dos termos GO para a an谩lise funcional. Utilizaci贸n de ferramentas bioinform谩ticas dese帽adas para iso.
叠颈辞颈苍蹿辞谤尘谩迟颈肠补 estrutural (10 CLE)
Principios b谩sicos de estrutura de biomol茅culas. An谩lise de estrutura de prote铆nas. Clasificaci贸n estrutural de prote铆nas: Bases de datos. Noci贸ns elementais de modelizaci贸n molecular. Predici贸n da estrutura de prote铆nas. Dese帽o de f谩rmacos por computador
Temario doutras actividades (pr谩cticas, seminarios, titor铆as, etc)
An谩lise e manexo de secuencias de nucle贸tidos e prote铆nas (8 CLIL)
Pr谩ctica 1: Obtenci贸n de datos de diferentes tipos a partir de bases bioinform谩ticas. Almacenamento e edici贸n dos mesmos cun software de manexo de texto plano.
Pr谩ctica 2 Utilizaci贸n dun programa de ali帽amento m煤ltiple e reconstruci贸n filogen茅tica
An谩lise de datos de expresi贸n g茅nica e 叠颈辞颈苍蹿辞谤尘谩迟颈肠补 funcional (8 CLIL)
Pr谩ctica 3 Manexo dun software estat铆stico adecuado para as an谩lises de expresi贸n g茅nica e xeraci贸n de listas de xenes expresados de maneira diferencial.
Pr谩ctica 4 Acceso 谩s ferramentas b谩sicas de an谩lises de pathways e an谩lise funcional.
Pr谩ctica 5 An谩lise enriquecida de expresi贸n g茅nica e procuras de termos GO
叠颈辞颈苍蹿辞谤尘谩迟颈肠补 estrutural (4 CLIL)
Pr谩ctica 6.- Construci贸n e visualizaci贸n de mol茅culas por computador.
Pr谩ctica 7.- Introduci贸n 谩 simulaci贸n computacional enfocada ao dese帽o de f谩rmacos.
-Bioinformatics and Functional Genomics, 3rd Edition. Jonathan Pevsner, October 2015 Wiley-Blackwell
-Bioinformatics and Computational Biology Solutions Using R and Bioconductor. Editors Robert GentlemanVincent J. CareyWolfgang HuberRafael A. IrizarrySandrine Dudoit 2005 Springer (recurso online de la B奇趣腾讯分分彩)
-Analysis of Phylogenetics and Evolution with R, Paradis, Emmanuel 2012 Springer (recurso online de la B奇趣腾讯分分彩)
-Molecular Modelling. Principles and Applications (Ed Pearson Education, 2001), Andrew R. Leach
-Introduction to Computational Chemistry (Ed Wiley), Frank Jensen.
-
-
-Material depositado na aula virtual.
Co帽ecementos:: Con02 y Con04.
Habilidades/Destrezas: H/D02, H/D10 y H/D13
Competencias: Comp03 y Comp05
A docencia expositiva ser谩 presencial, de asistencia obrigatoria e consistir谩 na impartici贸n de clases maxistrais
A docencia interactiva ser谩 presencial, de asistencia obrigatoria e consistir谩 en pr谩cticas en aula de inform谩tica.
As titor铆as en grupos reducidos ser谩n presenciais e dedicaranse 谩 resoluci贸n de d煤bidas.
A cualificaci贸n final de materia obterase mediante avaliaci贸n continua (50%) e exame final (50%)
Para a avaliaci贸n continua, valorarase a realizaci贸n de traballos por parte dos estudantes. No caso en que a avaliaci贸n continua fose suficientemente satisfactoria, poder铆a substitu铆r ao exame final.
Na segunda oportunidade, empregarase o mesmo sistema de avaliaci贸n: presentaci贸n de traballos e exame final.
Tanto a exposici贸n dos traballos como o exame final ser谩n presenciais.
Tanto na avaliaci贸n continua como no exame final avaliaranse as seguintes competencias, habilidades e co帽ecementos:
Comp02, Comp04, H/D02, H/D10, HD13, Con02 e Con04
Advertencia. Para os casos de realizaci贸n fraudulenta de exercicios ou probas (plaxios ou uso indebido das tecnolox铆as) ser谩 de aplicaci贸n o recolleito na 鈥淣ormativa de avaliaci贸n do rendemento acad茅mico dous estudantes e de revisi贸n de cualificaci贸ns鈥�.
Tempo de estudo e traballo persoal
TRABALLO PRESENCIAL NA aula
Clases expositivas (CLE): 30 horas
Clases interactivas de laboratorio (CLIL): 20 horas
Titor铆as en grupo (TI): 2 horas
Exame: 2
TRABALLO PERSOAL DO ESTUDANTE
Estudo aut贸nomo individual ou en grupo: 51 horas
Resoluci贸n de exercicios, redacci贸n de conclusi贸ns ou outros traballos: 15 horas
Programaci贸n / experimentaci贸n ou outros traballos en ordenador/aboratorio: 30 horas
Antonio M. G贸mez Tato
Coordinador/a- Departamento
- 惭补迟别尘谩迟颈肠补蝉
- 脕谤别补
- Xeometr铆a e Topolox铆a
- 罢别濒茅蹿辞苍辞
- 881813151
- Correo electr贸nico
- antonio.gomez.tato [at] usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Profesor/a: Catedr谩tico/a de Universidade
Rebeca Garcia Fandi帽o
- Departamento
- Qu铆mica Org谩nica
- 脕谤别补
- Qu铆mica Org谩nica
- Correo electr贸nico
- rebeca.garcia.fandino [at] usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Profesor/a: Titular de Universidade
Alejandro Seco Gonzalez
- Departamento
- Qu铆mica Org谩nica
- 脕谤别补
- Qu铆mica Org谩nica
- Correo electr贸nico
- alejandro.seco.gonzalez [at] usc.es
- 颁补迟别驳辞谤铆补
- Predoutoral 奇趣腾讯分分彩
| Luns | |||
|---|---|---|---|
| 12:00-13:00 | Grupo /CLE_01 | 颁补蝉迟别濒谩苍 | Aula 08. Louis Pasteur |
| Martes | |||
| 12:00-13:00 | Grupo /CLE_01 | 颁补蝉迟别濒谩苍 | Aula 08. Louis Pasteur |
| 惭茅谤肠辞谤别蝉 | |||
| 13:00-14:00 | Grupo /CLE_01 | 颁补蝉迟别濒谩苍 | Aula 08. Louis Pasteur |
| 22.01.2025 10:00-20:00 | Grupo /CLE_01 | Aula 04: James Watson e Francis Crick |
| 30.06.2025 10:00-20:00 | Grupo /CLE_01 | Aula 03. Carl Linneo |